毒芹是多年生粗壯草本，高70-100厘米。

　　主根短縮，支根多數，肉質或纖維狀，根狀莖有節，內有橫隔膜，褐色。

　　莖單生，直立，圓筒形，中空，有條紋，基部有時略帶淡紫色，上部有分枝，枝條上升開展。

　　基生葉柄長15-30厘米，葉鞘膜質，抱莖;葉片輪廓呈三角形或三角狀披針形，長12-20厘米，2-3回羽狀分裂;最下部的一對羽片有1-3.5厘米長的柄，羽片3裂至羽裂，裂片線狀披針形或窄披針形，長1.5-6厘米，寬3-10毫米，表面綠色，背面淡綠色，邊緣疏生鈍或銳鋸齒，兩面無毛或脈上有糙毛，較上部的莖生葉有短柄，葉片的分裂形狀如同基生葉;最上部的莖生葉1-2回羽狀分裂，末回裂片狹披針形，長1-2厘米，寬2-5毫米，邊緣疏生鋸齒。

　　復傘形花序頂生或腋生，花序梗長2.5-10厘米，無毛;總苞片通常無或有1線形的苞片;傘輻6-25，近等長，長2-3.5厘米;小總苞片多數，線狀披針形，長3-5毫米，寬0.5-0.7毫米，頂端長尖，中脈1條。小傘形花序有花15-35，花柄長4-7毫米;萼齒明顯，卵狀三角形;花瓣白色，倒卵形或近圓形，長1.5-2毫米，寬1-1.5毫米，頂端有內折的小舌片，中脈1條;花絲長約2.5毫米，花藥近卵圓形，長約0.7毫米，寬0.5毫米;花柱基幼時扁壓，光滑;花柱短，長約1毫米，向外反折。

　　分生果近卵圓形，長、寬2-3毫米，合生面收縮，主棱闊，木栓質，每棱槽內油管1，合生面油管2;胚乳腹面微凹。花果期7-8月。